某学校的一个生物学兴趣小组进行了一项实验来验证孟德尔的遗传定律。该小组用碗豆的两对相对性状做实验，选取了黄色圆粒（黄色与圆粒都是显性性状，基因分别用Y、R表示）碗豆与某碗豆作为亲本杂交，F1中黄色：绿色=3：1，圆粒：皱粒=1：1。请根据实验结果回答有关问题：
（1）用学过的知识解释为什么F1代中出现黄色和绿色种子的比值是3：1？
（2）让F1中所有的黄色圆粒碗豆自交，如果这两对性状的遗传符合基因的自由组合定律，后代中纯合黄色皱粒碗豆占的比例是 。
（3）请你利用亲本中的黄色圆粒碗豆为材料设计实验，验证这两对性状的遗传符合基因的自由组合定律。（要求：实验设计方案科学、合理、简明）